Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TROQ12816 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TROQ12816 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TROQ12816 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TROQ12816 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TROQ12816 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TROQ12816 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TROQ12816 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TROQ12816 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TROQ12816 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TROQ12816 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TROQ12816 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TROQ12816 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TROQ12816 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TROQ12816 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TROQ12816 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TROQ12816 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TROQ12816 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TROQ12816 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TROQ12816 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TROQ12816 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TROQ12816 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TROQ12816 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TROQ12816 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TROQ12816 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TROQ12816 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TROQ12816 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TROQ12816 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TROQ12816 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TROQ12816 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TROQ12816 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TROQ12816 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TROQ12816 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TROQ12816 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TROQ12816 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TROQ12816 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TROQ12816 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TROQ12816 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TROQ12816 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TROQ12816 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TROQ12816 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TROQ12816 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TROQ12816 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TROQ12816 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
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