Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNH2Q12809 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms