Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGNL1Q0VF96 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms