Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBRQ0VD83 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms