Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MS4A2Q01362 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms