Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BEX3Q00994 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BEX3Q00994 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms