Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms