Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms