Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLK1P49759 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLK1P49759 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLK1P49759 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLK1P49759 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLK1P49759 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLK1P49759 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLK1P49759 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLK1P49759 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLK1P49759 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLK1P49759 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLK1P49759 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLK1P49759 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms