Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC4A3P48751 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms