Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPOP42166 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPOP42166 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPOP42166 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPOP42166 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPOP42166 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPOP42166 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPOP42166 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPOP42166 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPOP42166 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPOP42166 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPOP42166 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPOP42166 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPOP42166 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPOP42166 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPOP42166 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPOP42166 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPOP42166 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMPOP42166 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMPOP42166 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMPOP42166 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMPOP42166 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms