Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CLIP1P30622 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLIP1P30622 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms