Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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HOXA5P20719 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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HOXA5P20719 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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HOXA5P20719 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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HOXA5P20719 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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HOXA5P20719 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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HOXA5P20719 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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HOXA5P20719 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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HOXA5P20719 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
HOXA5P20719 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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