Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms