Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP2A2P16615 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms