Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACADSP16219 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACADSP16219 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSP16219 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSP16219 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSP16219 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSP16219 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACADSP16219 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms