Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTN1P12814 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms