Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DMDP11532 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DMDP11532 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DMDP11532 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMDP11532 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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