Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SYNGR2O43760 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms