Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 AC012454.1-201ENST00000443948 995 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 IL4-201ENST00000231449 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 IL4-204ENST00000622422 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP3K13O43283 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms