Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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NDUFS4O43181 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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NDUFS4O43181 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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NDUFS4O43181 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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NDUFS4O43181 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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NDUFS4O43181 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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NDUFS4O43181 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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NDUFS4O43181 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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NDUFS4O43181 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NDUFS4O43181 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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