Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ERVV-2B6SEH9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ERVV-2B6SEH9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms