Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms