Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT5

EXOSC3, Exosome complex component RRP40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC3Q9NQT5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC3Q9NQT5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms