Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL9

DMRT3, Doublesex- and mab-3-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRT3Q9NQL9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DMRT3Q9NQL9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DMRT3Q9NQL9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DMRT3Q9NQL9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DMRT3Q9NQL9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DMRT3Q9NQL9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DMRT3Q9NQL9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DMRT3Q9NQL9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DMRT3Q9NQL9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DMRT3Q9NQL9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DMRT3Q9NQL9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DMRT3Q9NQL9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DMRT3Q9NQL9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DMRT3Q9NQL9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DMRT3Q9NQL9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DMRT3Q9NQL9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DMRT3Q9NQL9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DMRT3Q9NQL9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DMRT3Q9NQL9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DMRT3Q9NQL9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DMRT3Q9NQL9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DMRT3Q9NQL9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DMRT3Q9NQL9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DMRT3Q9NQL9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms