Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTDSP1Q9GZU7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTDSP1Q9GZU7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms