Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COPS4Q9BT78 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms