Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR3

TMEM246, Transmembrane protein 246, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM246Q9BRR3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM246Q9BRR3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM246Q9BRR3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM246Q9BRR3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMEM246Q9BRR3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM246Q9BRR3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM246Q9BRR3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM246Q9BRR3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM246Q9BRR3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM246Q9BRR3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM246Q9BRR3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM246Q9BRR3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMEM246Q9BRR3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMEM246Q9BRR3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMEM246Q9BRR3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM246Q9BRR3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM246Q9BRR3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms