Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA0

PCDHB18P, Putative protocadherin beta-18, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB18PQ96TA0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCDHB18PQ96TA0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB18PQ96TA0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCDHB18PQ96TA0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCDHB18PQ96TA0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCDHB18PQ96TA0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB18PQ96TA0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB18PQ96TA0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB18PQ96TA0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB18PQ96TA0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB18PQ96TA0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB18PQ96TA0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB18PQ96TA0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB18PQ96TA0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB18PQ96TA0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB18PQ96TA0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB18PQ96TA0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB18PQ96TA0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms