Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCCAG3Q96C92 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDCCAG3Q96C92 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDCCAG3Q96C92 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms