Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FRAT1Q92837 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FRAT1Q92837 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FRAT1Q92837 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FRAT1Q92837 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
FRAT1Q92837 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FRAT1Q92837 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FRAT1Q92837 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FRAT1Q92837 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FRAT1Q92837 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FRAT1Q92837 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FRAT1Q92837 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FRAT1Q92837 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FRAT1Q92837 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRAT1Q92837 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRAT1Q92837 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
FRAT1Q92837 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRAT1Q92837 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FRAT1Q92837 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
FRAT1Q92837 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FRAT1Q92837 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FRAT1Q92837 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRAT1Q92837 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRAT1Q92837 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FRAT1Q92837 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
FRAT1Q92837 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FRAT1Q92837 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FRAT1Q92837 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
FRAT1Q92837 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
FRAT1Q92837 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FRAT1Q92837 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FRAT1Q92837 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FRAT1Q92837 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FRAT1Q92837 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FRAT1Q92837 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms