Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bgrl3Q91VW3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bgrl3Q91VW3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.7 ms