Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMUB2Q71RG4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMUB2Q71RG4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMUB2Q71RG4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms