Protein–RNA interactions for Protein: Q69YL0

NCBP2-AS2, Uncharacterized protein NCBP2-AS2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2-AS2Q69YL0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP2-AS2Q69YL0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP2-AS2Q69YL0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCBP2-AS2Q69YL0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCBP2-AS2Q69YL0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NCBP2-AS2Q69YL0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCBP2-AS2Q69YL0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NCBP2-AS2Q69YL0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCBP2-AS2Q69YL0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCBP2-AS2Q69YL0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NCBP2-AS2Q69YL0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCBP2-AS2Q69YL0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NCBP2-AS2Q69YL0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NCBP2-AS2Q69YL0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms