Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CREB3L3Q68CJ9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CREB3L3Q68CJ9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CREB3L3Q68CJ9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms