Protein–RNA interactions for Protein: Q61122

Nab1, NGFI-A-binding protein 1, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nab1Q61122 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nab1Q61122 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nab1Q61122 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nab1Q61122 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nab1Q61122 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nab1Q61122 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nab1Q61122 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nab1Q61122 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nab1Q61122 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nab1Q61122 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nab1Q61122 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nab1Q61122 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nab1Q61122 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nab1Q61122 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nab1Q61122 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nab1Q61122 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nab1Q61122 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nab1Q61122 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nab1Q61122 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nab1Q61122 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nab1Q61122 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nab1Q61122 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nab1Q61122 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nab1Q61122 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms