Protein–RNA interactions for Protein: Q17RP2

TIGD6, Tigger transposable element-derived protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD6Q17RP2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TIGD6Q17RP2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TIGD6Q17RP2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms