Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VAMP3Q15836 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VAMP3Q15836 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VAMP3Q15836 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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