Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA3AQ14563 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEMA3AQ14563 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3AQ14563 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3AQ14563 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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