Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 CWC27YPL064C 906 nt6.66□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 MLC2YPR188C 492 nt6.66□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 RRP9YPR137W 1722 nt6.66□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 PDH1YPR002W 1551 nt6.65□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 YDR053WYDR053W 396 nt6.65□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 CWC21YDR482C 408 nt6.65□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 YPR098CYPR098C 486 nt6.65□□□□□ -1.34
LSP1Q12230 DUG1YFR044C 1446 nt6.65□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 RFA1YAR007C 1866 nt6.64□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 QRI5YLR204W 336 nt6.64□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 HOR7YMR251W-A 180 nt6.64□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 RNH201YNL072W 924 nt6.64□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 MRP51YPL118W 1035 nt6.64□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 GCV3YAL044C 513 nt6.63□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 DRE2YKR071C 1047 nt6.63□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 AMD1YML035C 2433 nt6.63□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 CSG2YBR036C 1233 nt6.63□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 YKR023WYKR023W 1593 nt6.62□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 UGX2YDL169C 672 nt6.62□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 COG1YGL223C 1254 nt6.62□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 RPS15YOL040C 429 nt6.62□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 RET1YOR207C 3450 nt6.62□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 YLR296WYLR296W 327 nt6.61□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 PGA2YNL149C 390 nt6.61□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 ADE12YNL220W 1302 nt6.6□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 OPI7YDR360W 435 nt6.6□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 YIL060WYIL060W 435 nt6.6□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 GEP5YLR091W 882 nt6.6□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 IDP3YNL009W 1263 nt6.6□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 GLE1YDL207W 1617 nt6.59□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 YDL114WYDL114W 927 nt6.59□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt6.59□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 YBR144CYBR144C 315 nt6.59□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 HSP104YLL026W 2727 nt6.59□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 TEL2YGR099W 2067 nt6.59□□□□□ -1.35
LSP1Q12230 PDC1YLR044C 1692 nt6.58□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 RHO4YKR055W 876 nt6.58□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 HCR1YLR192C 798 nt6.58□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 YML012C-AYML012C-A 378 nt6.58□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 MRPS5YBR251W 924 nt6.58□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 VTC2YFL004W 2487 nt6.58□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 PRI2YKL045W 1587 nt6.57□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 DBP9YLR276C 1785 nt6.57□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 ASK1YKL052C 879 nt6.57□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 STE13YOR219C 2796 nt6.57□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 SKS1YPL026C 1509 nt6.56□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 CRZ1YNL027W 2037 nt6.56□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 BAP2YBR068C 1830 nt6.56□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 RRP4YHR069C 1080 nt6.56□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 YKL031WYKL031W 414 nt6.56□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 YML018CYML018C 1182 nt6.56□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 ERI1YPL096C-A 207 nt6.56□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 YTH1YPR107C 627 nt6.56□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 SEC12YNR026C 1416 nt6.56□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 GDA1YEL042W 1557 nt6.56□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt6.55□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 BUD32YGR262C 786 nt6.55□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 SRY1YKL218C 981 nt6.55□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 YLR463CYLR463C 552 nt6.55□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 SPG4YMR107W 348 nt6.55□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 RPS9AYPL081W 594 nt6.55□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 YIR007WYIR007W 2295 nt6.55□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 YAP1801YHR161C 1914 nt6.54□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 YFR006WYFR006W 1608 nt6.54□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 NQM1YGR043C 1002 nt6.54□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 SPG1YGR236C 288 nt6.54□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 PRP46YPL151C 1356 nt6.54□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 MNN2YBR015C 1794 nt6.54□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 HXT3YDR345C 1704 nt6.53□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 STL1YDR536W 1710 nt6.53□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 TIM22YDL217C 624 nt6.53□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 FZF1YGL254W 900 nt6.53□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 SSZ1YHR064C 1617 nt6.53□□□□□ -1.36
LSP1Q12230 SCT1YBL011W 2280 nt6.52□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 UTP18YJL069C 1785 nt6.52□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 TRP5YGL026C 2124 nt6.52□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 YBL044WYBL044W 369 nt6.52□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 YPL136WYPL136W 369 nt6.52□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 BUD9YGR041W 1644 nt6.51□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 FAF1YIL019W 1041 nt6.51□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 TKL1YPR074C 2043 nt6.5□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 SGV1YPR161C 1974 nt6.5□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 SIA1YOR137C 1869 nt6.5□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 COR1YBL045C 1374 nt6.5□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 TEF1YPR080W 1377 nt6.5□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 TEF2YBR118W 1377 nt6.5□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 GLO2YDR272W 825 nt6.5□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 PMP3YDR276C 168 nt6.5□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 MTQ2YDR140W 666 nt6.49□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 CDC43YGL155W 1131 nt6.49□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 MTQ1YNL063W 945 nt6.48□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 FAT3YKL187C 2253 nt6.48□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 SMF3YLR034C 1422 nt6.48□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 BUL1YMR275C 2931 nt6.48□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 GPT2YKR067W 2232 nt6.48□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 ISN1YOR155C 1353 nt6.47□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 ALT1YLR089C 1779 nt6.47□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 FOL1YNL256W 2475 nt6.47□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 YKR041WYKR041W 753 nt6.47□□□□□ -1.37
LSP1Q12230 ASF2YDL197C 1578 nt6.47□□□□□ -1.37
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