Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF90Q03938 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF90Q03938 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms