Protein–RNA interactions for Protein: P78344

EIF4G2, Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4G2P78344 EIPR1-210ENST00000463662 757 ntTSL 312.74□□□□□ -0.376e-7■■■■■ 41
EIF4G2P78344 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.687e-7■■■■■ 41
EIF4G2P78344 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.557e-7■■■■■ 41
EIF4G2P78344 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.381e-6■■■■■ 41
EIF4G2P78344 RALY-205ENST00000442805 871 ntTSL 534.93■■■■□ 3.181e-6■■■■■ 41
EIF4G2P78344 RALY-206ENST00000448364 1204 ntTSL 233.88■■■■□ 3.011e-6■■■■■ 41
EIF4G2P78344 RALY-202ENST00000333552 786 ntTSL 329.7■■■□□ 2.351e-6■■■■■ 41
EIF4G2P78344 RALY-204ENST00000413297 766 ntTSL 528.88■■■□□ 2.211e-6■■■■■ 41
EIF4G2P78344 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.461e-6■■■■■ 41
EIF4G2P78344 RALY-210ENST00000493399 513 ntTSL 520.37■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 41
EIF4G2P78344 CARM1-209ENST00000590699 2240 ntTSL 539.19■■■■□ 3.862e-8■■■■■ 40.9
EIF4G2P78344 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.232e-8■■■■■ 40.9
EIF4G2P78344 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.172e-8■■■■■ 40.9
EIF4G2P78344 CARM1-205ENST00000586508 1050 ntTSL 223.24■■□□□ 1.312e-8■■■■■ 40.9
EIF4G2P78344 CARM1-203ENST00000586221 2766 ntTSL 1 (best)21.86■■□□□ 1.092e-8■■■■■ 40.9
EIF4G2P78344 CARM1-204ENST00000586298 674 ntTSL 521.77■■□□□ 1.082e-8■■■■■ 40.9
EIF4G2P78344 APBA2-209ENST00000559709 594 ntTSL 433.69■■■□□ 2.982e-6■■■■■ 40.9
EIF4G2P78344 APBA2-210ENST00000559814 2555 ntTSL 1 (best)26.24■■□□□ 1.792e-6■■■■■ 40.9
EIF4G2P78344 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.021e-6■■■■■ 40.9
EIF4G2P78344 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.951e-6■■■■■ 40.9
EIF4G2P78344 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.611e-6■■■■■ 40.9
EIF4G2P78344 ZNF566-207ENST00000472909 587 ntTSL 425.96■■□□□ 1.757e-7■■■■■ 40.9
EIF4G2P78344 ZNF566-210ENST00000494354 925 ntTSL 425.96■■□□□ 1.757e-7■■■■■ 40.9
EIF4G2P78344 ZNF566-209ENST00000493391 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.117e-7■■■■■ 40.9
EIF4G2P78344 ZNF566-204ENST00000434377 5197 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.137e-7■■■■■ 40.9
EIF4G2P78344 ZNF566-203ENST00000427002 584 ntTSL 212.13□□□□□ -0.477e-7■■■■■ 40.9
EIF4G2P78344 ZNF566-201ENST00000392170 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.747e-7■■■■■ 40.9
EIF4G2P78344 ZNF566-208ENST00000480361 474 ntTSL 49.93□□□□□ -0.827e-7■■■■■ 40.9
EIF4G2P78344 ZNF566-205ENST00000452939 793 ntTSL 29.41□□□□□ -0.97e-7■■■■■ 40.9
EIF4G2P78344 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.957e-7■■■■■ 40.9
EIF4G2P78344 ZNF566-206ENST00000460937 570 ntTSL 47.39□□□□□ -1.237e-7■■■■■ 40.9
EIF4G2P78344 SLC22A20-201ENST00000525264 1419 ntTSL 1 (best)25.87■■□□□ 1.732e-6■■■■■ 40.8
EIF4G2P78344 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.83■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 40.8
EIF4G2P78344 SLC22A20-203ENST00000529062 1939 ntTSL 522.23■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 40.8
EIF4G2P78344 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 40.8
EIF4G2P78344 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.564e-7■■■■■ 40.8
EIF4G2P78344 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.544e-7■■■■■ 40.8
EIF4G2P78344 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.21e-6■■■■■ 40.7
EIF4G2P78344 CXXC5-209ENST00000507139 472 ntTSL 429.97■■■□□ 2.394e-7■■■■■ 40.6
EIF4G2P78344 CXXC5-206ENST00000504844 777 ntTSL 229.21■■■□□ 2.274e-7■■■■■ 40.6
EIF4G2P78344 CXXC5-203ENST00000502336 581 ntTSL 427.14■■□□□ 1.944e-7■■■■■ 40.6
EIF4G2P78344 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.884e-7■■■■■ 40.6
EIF4G2P78344 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.634e-7■■■■■ 40.6
EIF4G2P78344 CXXC5-202ENST00000502295 503 ntTSL 422.67■■□□□ 1.224e-7■■■■■ 40.6
EIF4G2P78344 CXXC5-216ENST00000520967 878 ntTSL 322.1■■□□□ 1.134e-7■■■■■ 40.6
EIF4G2P78344 CXXC5-207ENST00000504944 568 ntTSL 320.04■□□□□ 0.84e-7■■■■■ 40.6
EIF4G2P78344 NRSN2-204ENST00000492242 846 ntTSL 229.61■■■□□ 2.333e-8■■■■■ 40.6
EIF4G2P78344 MAEA-206ENST00000503693 1182 ntTSL 1 (best)27.33■■□□□ 1.975e-7■■■■■ 40.6
EIF4G2P78344 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.663e-8■■■■■ 40.6
EIF4G2P78344 MAEA-216ENST00000512308 839 ntTSL 523.29■■□□□ 1.325e-7■■■■■ 40.6
EIF4G2P78344 MAEA-211ENST00000509254 598 ntTSL 422.24■■□□□ 1.155e-7■■■■■ 40.6
EIF4G2P78344 NRSN2-208ENST00000609179 578 ntTSL 321.27■■□□□ 13e-8■■■■■ 40.6
EIF4G2P78344 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.933e-8■■■■■ 40.6
EIF4G2P78344 NRSN2-209ENST00000609504 582 ntTSL 319.78■□□□□ 0.763e-8■■■■■ 40.6
EIF4G2P78344 NRSN2-205ENST00000608467 504 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.543e-8■■■■■ 40.6
EIF4G2P78344 NRSN2-203ENST00000470439 697 ntTSL 218.13■□□□□ 0.493e-8■■■■■ 40.6
EIF4G2P78344 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.371e-6■■■■■ 40.6
EIF4G2P78344 PIGU-201ENST00000217446 1632 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best)22.23■■□□□ 1.151e-6■■■■■ 40.6
EIF4G2P78344 PIGU-203ENST00000438215 509 ntTSL 312.22□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 40.6
EIF4G2P78344 NTRK1-210ENST00000534682 844 ntTSL 417.75■□□□□ 0.433e-10■■■■■ 40.6
EIF4G2P78344 MAP4-212ENST00000468075 487 ntTSL 521.67■■□□□ 1.063e-7■■■■■ 40.5
EIF4G2P78344 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.033e-7■■■■■ 40.5
EIF4G2P78344 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.453e-7■■■■■ 40.5
EIF4G2P78344 MAP4-207ENST00000426837 8920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 40.5
EIF4G2P78344 MAP4-206ENST00000423088 899 ntTSL 312.23□□□□□ -0.453e-7■■■■■ 40.5
EIF4G2P78344 MAP4-210ENST00000439356 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 40.5
EIF4G2P78344 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.477e-7■■■■■ 40.5
EIF4G2P78344 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.477e-7■■■■■ 40.5
EIF4G2P78344 STX3-205ENST00000530498 690 ntTSL 222.68■■□□□ 1.227e-7■■■■■ 40.5
EIF4G2P78344 STX3-206ENST00000533637 1024 ntTSL 221.4■■□□□ 1.027e-7■■■■■ 40.5
EIF4G2P78344 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.737e-7■■■■■ 40.5
EIF4G2P78344 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC6.72□□□□□ -1.337e-7■■■■■ 40.5
EIF4G2P78344 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.421e-15■■■■■ 40.5
EIF4G2P78344 GGA2-213ENST00000568922 1807 ntTSL 217.84■□□□□ 0.451e-15■■■■■ 40.5
EIF4G2P78344 GGA2-201ENST00000309859 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.121e-15■■■■■ 40.5
EIF4G2P78344 GGA2-210ENST00000567339 293 ntTSL 313.87□□□□□ -0.191e-15■■■■■ 40.5
EIF4G2P78344 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.097e-7■■■■■ 40.5
EIF4G2P78344 EIPR1-207ENST00000444776 594 ntTSL 423.36■■□□□ 1.337e-7■■■■■ 40.5
EIF4G2P78344 SMYD3-215ENST00000490322 368 ntTSL 34.23□□□□□ -1.738e-9■■■■■ 40.4
EIF4G2P78344 ROR2-205ENST00000495386 664 ntTSL 319.47■□□□□ 0.717e-7■■■■■ 40.4
EIF4G2P78344 ROR2-206ENST00000546883 501 ntTSL 318.36■□□□□ 0.537e-7■■■■■ 40.4
EIF4G2P78344 ASCC2-206ENST00000449900 580 ntTSL 327.93■■■□□ 2.067e-7■■■■■ 40.3
EIF4G2P78344 ASCC2-210ENST00000460313 568 ntTSL 227.83■■■□□ 2.057e-7■■■■■ 40.3
EIF4G2P78344 ASCC2-221ENST00000495681 536 ntTSL 526.08■■□□□ 1.777e-7■■■■■ 40.3
EIF4G2P78344 ASCC2-222ENST00000495967 554 ntTSL 426.08■■□□□ 1.777e-7■■■■■ 40.3
EIF4G2P78344 ASCC2-208ENST00000454854 469 ntTSL 426.08■■□□□ 1.777e-7■■■■■ 40.3
EIF4G2P78344 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.657e-7■■■■■ 40.3
EIF4G2P78344 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.577e-7■■■■■ 40.3
EIF4G2P78344 ASCC2-207ENST00000453160 529 ntTSL 420.84■□□□□ 0.937e-7■■■■■ 40.3
EIF4G2P78344 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.87e-7■■■■■ 40.3
EIF4G2P78344 ASCC2-209ENST00000458594 2753 ntTSL 516.16■□□□□ 0.187e-7■■■■■ 40.3
EIF4G2P78344 ASCC2-211ENST00000462454 491 ntTSL 314.64□□□□□ -0.077e-7■■■■■ 40.3
EIF4G2P78344 ASCC2-205ENST00000431535 873 ntTSL 513.15□□□□□ -0.37e-7■■■■■ 40.3
EIF4G2P78344 ASCC2-204ENST00000412689 742 ntTSL 312.85□□□□□ -0.357e-7■■■■■ 40.3
EIF4G2P78344 ASCC2-214ENST00000465667 876 ntTSL 312.85□□□□□ -0.357e-7■■■■■ 40.3
EIF4G2P78344 PRDM15-214ENST00000491486 520 ntTSL 321.62■■□□□ 1.056e-7■■■■■ 40.3
EIF4G2P78344 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.964e-7■■■■■ 40.3
EIF4G2P78344 PRDM15-216ENST00000496124 435 ntTSL 320.38■□□□□ 0.856e-7■■■■■ 40.3
EIF4G2P78344 PRDM15-213ENST00000489661 856 ntTSL 320.08■□□□□ 0.816e-7■■■■■ 40.3
EIF4G2P78344 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 40.3
Retrieved 100 of 8,962 protein–RNA pairs in 49.7 ms