Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr1bP70700 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Polr1bP70700 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Polr1bP70700 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms