Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Surf6P70279 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Surf6P70279 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Surf6P70279 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Surf6P70279 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Surf6P70279 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Surf6P70279 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Surf6P70279 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Surf6P70279 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Surf6P70279 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Surf6P70279 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms