Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LUMP51884 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LUMP51884 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LUMP51884 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LUMP51884 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LUMP51884 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LUMP51884 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LUMP51884 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LUMP51884 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LUMP51884 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LUMP51884 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LUMP51884 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LUMP51884 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LUMP51884 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LUMP51884 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LUMP51884 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LUMP51884 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LUMP51884 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LUMP51884 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LUMP51884 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LUMP51884 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LUMP51884 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LUMP51884 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LUMP51884 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LUMP51884 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LUMP51884 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LUMP51884 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LUMP51884 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LUMP51884 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LUMP51884 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LUMP51884 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LUMP51884 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LUMP51884 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LUMP51884 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LUMP51884 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LUMP51884 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LUMP51884 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LUMP51884 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LUMP51884 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LUMP51884 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LUMP51884 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LUMP51884 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LUMP51884 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LUMP51884 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LUMP51884 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LUMP51884 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LUMP51884 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LUMP51884 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LUMP51884 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LUMP51884 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LUMP51884 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LUMP51884 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LUMP51884 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LUMP51884 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LUMP51884 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LUMP51884 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LUMP51884 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LUMP51884 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LUMP51884 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LUMP51884 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LUMP51884 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LUMP51884 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LUMP51884 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LUMP51884 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LUMP51884 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LUMP51884 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LUMP51884 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LUMP51884 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LUMP51884 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LUMP51884 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LUMP51884 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LUMP51884 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LUMP51884 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LUMP51884 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LUMP51884 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LUMP51884 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LUMP51884 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LUMP51884 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LUMP51884 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LUMP51884 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LUMP51884 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LUMP51884 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LUMP51884 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LUMP51884 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LUMP51884 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LUMP51884 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LUMP51884 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LUMP51884 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LUMP51884 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LUMP51884 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LUMP51884 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LUMP51884 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LUMP51884 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LUMP51884 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LUMP51884 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LUMP51884 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LUMP51884 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LUMP51884 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LUMP51884 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LUMP51884 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms