Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCR4P51679 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCR4P51679 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCR4P51679 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCR4P51679 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCR4P51679 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCR4P51679 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCR4P51679 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCR4P51679 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCR4P51679 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCR4P51679 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCR4P51679 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCR4P51679 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCR4P51679 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCR4P51679 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCR4P51679 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCR4P51679 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCR4P51679 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCR4P51679 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCR4P51679 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCR4P51679 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCR4P51679 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCR4P51679 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCR4P51679 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCR4P51679 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCR4P51679 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCR4P51679 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCR4P51679 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCR4P51679 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCR4P51679 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCR4P51679 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCR4P51679 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCR4P51679 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCR4P51679 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCR4P51679 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCR4P51679 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCR4P51679 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCR4P51679 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCR4P51679 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCR4P51679 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCR4P51679 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCR4P51679 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCR4P51679 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCR4P51679 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCR4P51679 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCR4P51679 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCR4P51679 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCR4P51679 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCR4P51679 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCR4P51679 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCR4P51679 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCR4P51679 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCR4P51679 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCR4P51679 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCR4P51679 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCR4P51679 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCR4P51679 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCR4P51679 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCR4P51679 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCR4P51679 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCR4P51679 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCR4P51679 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCR4P51679 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCR4P51679 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCR4P51679 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCR4P51679 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCR4P51679 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCR4P51679 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCR4P51679 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCR4P51679 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCR4P51679 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCR4P51679 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCR4P51679 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCR4P51679 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCR4P51679 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCR4P51679 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCR4P51679 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCR4P51679 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCR4P51679 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCR4P51679 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCR4P51679 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCR4P51679 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCR4P51679 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCR4P51679 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCR4P51679 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCR4P51679 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCR4P51679 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCR4P51679 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCR4P51679 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCR4P51679 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCR4P51679 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCR4P51679 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCR4P51679 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCR4P51679 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCR4P51679 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCR4P51679 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCR4P51679 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCR4P51679 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCR4P51679 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCR4P51679 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms