Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GNPDA1P46926 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GNPDA1P46926 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GNPDA1P46926 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms