Protein–RNA interactions for Protein: P36075

CUE2, Ubiquitin-binding protein CUE2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE2P36075 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt6□□□□□ -1.45
CUE2P36075 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt6□□□□□ -1.45
CUE2P36075 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt6□□□□□ -1.45
CUE2P36075 MRP51YPL118W 1035 nt6□□□□□ -1.45
CUE2P36075 GUP2YPL189W 1830 nt5.99□□□□□ -1.45
CUE2P36075 SAC6YDR129C 1929 nt5.99□□□□□ -1.45
CUE2P36075 YDL023CYDL023C 321 nt5.99□□□□□ -1.45
CUE2P36075 YDL158CYDL158C 309 nt5.99□□□□□ -1.45
CUE2P36075 ECM14YHR132C 1293 nt5.99□□□□□ -1.45
CUE2P36075 RMA1YKL132C 1293 nt5.99□□□□□ -1.45
CUE2P36075 YNR040WYNR040W 771 nt5.99□□□□□ -1.45
CUE2P36075 MAF1YDR005C 1188 nt5.98□□□□□ -1.45
CUE2P36075 TAL1YLR354C 1008 nt5.98□□□□□ -1.45
CUE2P36075 TSA1YML028W 591 nt5.98□□□□□ -1.45
CUE2P36075 QNS1YHR074W 2145 nt5.98□□□□□ -1.45
CUE2P36075 CRZ1YNL027W 2037 nt5.98□□□□□ -1.45
CUE2P36075 URA1YKL216W 945 nt5.97□□□□□ -1.45
CUE2P36075 AAT2YLR027C 1257 nt5.97□□□□□ -1.45
CUE2P36075 YBR027CYBR027C 333 nt5.97□□□□□ -1.45
CUE2P36075 ILV6YCL009C 930 nt5.97□□□□□ -1.45
CUE2P36075 ALD6YPL061W 1503 nt5.97□□□□□ -1.45
CUE2P36075 YLL067CYLL067C 3618 nt5.97□□□□□ -1.45
CUE2P36075 HIR1YBL008W 2523 nt5.97□□□□□ -1.45
CUE2P36075 XBP1YIL101C 1944 nt5.97□□□□□ -1.45
CUE2P36075 RAD3YER171W 2337 nt5.96□□□□□ -1.46
CUE2P36075 GEP5YLR091W 882 nt5.96□□□□□ -1.46
CUE2P36075 YNL319WYNL319W 441 nt5.96□□□□□ -1.46
CUE2P36075 DDC1YPL194W 1839 nt5.96□□□□□ -1.46
CUE2P36075 MCM3YEL032W 2916 nt5.96□□□□□ -1.46
CUE2P36075 PKC1YBL105C 3456 nt5.96□□□□□ -1.46
CUE2P36075 TFC6YDR362C 2019 nt5.95□□□□□ -1.46
CUE2P36075 YJL171CYJL171C 1191 nt5.95□□□□□ -1.46
CUE2P36075 RSA3YLR221C 663 nt5.95□□□□□ -1.46
CUE2P36075 GUA1YMR217W 1578 nt5.95□□□□□ -1.46
CUE2P36075 IDP3YNL009W 1263 nt5.95□□□□□ -1.46
CUE2P36075 NHA1YLR138W 2958 nt5.95□□□□□ -1.46
CUE2P36075 YIL092WYIL092W 1902 nt5.95□□□□□ -1.46
CUE2P36075 BUD9YGR041W 1644 nt5.95□□□□□ -1.46
CUE2P36075 SSK22YCR073C 3996 nt5.95□□□□□ -1.46
CUE2P36075 VMS1YDR049W 1899 nt5.94□□□□□ -1.46
CUE2P36075 CDC34YDR054C 888 nt5.94□□□□□ -1.46
CUE2P36075 YEL068CYEL068C 333 nt5.94□□□□□ -1.46
CUE2P36075 YGR011WYGR011W 327 nt5.94□□□□□ -1.46
CUE2P36075 YJU3YKL094W 942 nt5.94□□□□□ -1.46
CUE2P36075 NMD4YLR363C 657 nt5.94□□□□□ -1.46
CUE2P36075 YOL107WYOL107W 1029 nt5.94□□□□□ -1.46
CUE2P36075 YOL131WYOL131W 327 nt5.94□□□□□ -1.46
CUE2P36075 PRM4YPL156C 855 nt5.94□□□□□ -1.46
CUE2P36075 YPR114WYPR114W 948 nt5.94□□□□□ -1.46
CUE2P36075 RPO26YPR187W 468 nt5.94□□□□□ -1.46
CUE2P36075 SLX1YBR228W 915 nt5.94□□□□□ -1.46
CUE2P36075 HSP78YDR258C 2436 nt5.93□□□□□ -1.46
CUE2P36075 COX20YDR231C 618 nt5.93□□□□□ -1.46
CUE2P36075 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.93□□□□□ -1.46
CUE2P36075 LDS1YAL018C 978 nt5.93□□□□□ -1.46
CUE2P36075 FSF1YOR271C 984 nt5.93□□□□□ -1.46
CUE2P36075 PRE2YPR103W 864 nt5.93□□□□□ -1.46
CUE2P36075 MDM31YHR194W 1740 nt5.93□□□□□ -1.46
CUE2P36075 RVB2YPL235W 1416 nt5.92□□□□□ -1.46
CUE2P36075 AAP1YHR047C 2571 nt5.92□□□□□ -1.46
CUE2P36075 LSG1YGL099W 1923 nt5.92□□□□□ -1.46
CUE2P36075 OPT1YJL212C 2400 nt5.92□□□□□ -1.46
CUE2P36075 CUP2YGL166W 678 nt5.92□□□□□ -1.46
CUE2P36075 COS10YNR075W 1125 nt5.92□□□□□ -1.46
CUE2P36075 OSW1YOR255W 837 nt5.92□□□□□ -1.46
CUE2P36075 RPN7YPR108W 1290 nt5.92□□□□□ -1.46
CUE2P36075 PYC1YGL062W 3537 nt5.92□□□□□ -1.46
CUE2P36075 GEX2YKR106W 1848 nt5.92□□□□□ -1.46
CUE2P36075 SSK1YLR006C 2139 nt5.92□□□□□ -1.46
CUE2P36075 ERG7YHR072W 2196 nt5.91□□□□□ -1.46
CUE2P36075 BZZ1YHR114W 1902 nt5.91□□□□□ -1.46
CUE2P36075 CRF1YDR223W 1404 nt5.91□□□□□ -1.46
CUE2P36075 CHO1YER026C 831 nt5.91□□□□□ -1.46
CUE2P36075 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.91□□□□□ -1.46
CUE2P36075 HAP2YGL237C 798 nt5.91□□□□□ -1.46
CUE2P36075 COS6YGR295C 1146 nt5.91□□□□□ -1.46
CUE2P36075 YHR054CYHR054C 1065 nt5.91□□□□□ -1.46
CUE2P36075 YNL303WYNL303W 348 nt5.91□□□□□ -1.46
CUE2P36075 MRPS16YPL013C 366 nt5.91□□□□□ -1.46
CUE2P36075 NPL6YMR091C 1308 nt5.91□□□□□ -1.46
CUE2P36075 ATG4YNL223W 1485 nt5.9□□□□□ -1.46
CUE2P36075 MPC2YHR162W 390 nt5.9□□□□□ -1.46
CUE2P36075 PEX22YAL055W 543 nt5.9□□□□□ -1.46
CUE2P36075 SPC24YMR117C 642 nt5.9□□□□□ -1.46
CUE2P36075 ERC1YHR032W 1746 nt5.9□□□□□ -1.47
CUE2P36075 YEH1YLL012W 1722 nt5.9□□□□□ -1.47
CUE2P36075 SVF1YDR346C 1446 nt5.9□□□□□ -1.47
CUE2P36075 YPR196WYPR196W 1413 nt5.9□□□□□ -1.47
CUE2P36075 ATP1YBL099W 1638 nt5.89□□□□□ -1.47
CUE2P36075 YET3YDL072C 612 nt5.89□□□□□ -1.47
CUE2P36075 YDR187CYDR187C 519 nt5.89□□□□□ -1.47
CUE2P36075 RME1YGR044C 903 nt5.89□□□□□ -1.47
CUE2P36075 YHR022CYHR022C 771 nt5.89□□□□□ -1.47
CUE2P36075 ISR1YPR106W 1332 nt5.89□□□□□ -1.47
CUE2P36075 YPK2YMR104C 2034 nt5.89□□□□□ -1.47
CUE2P36075 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.88□□□□□ -1.47
CUE2P36075 YGR283CYGR283C 1026 nt5.88□□□□□ -1.47
CUE2P36075 VPS24YKL041W 675 nt5.88□□□□□ -1.47
CUE2P36075 DBR1YKL149C 1218 nt5.88□□□□□ -1.47
CUE2P36075 ECM9YKR004C 1134 nt5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.4 ms