Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACTN2P35609 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACTN2P35609 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN2P35609 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms