Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTPN3P26045 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTPN3P26045 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPN3P26045 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142 ms